Євгеній Каньковський народився 20 лютого 1996 року у місті Хмельницькому.
Навчався в Хмельницькій ЗОШ №1. Закінчив Державний податковий університет в м. Ірпінь, юридичний факультет.
У мирному житті Євгеній працював за фахом, у юридичній фірмі.
Чоловік приєднався до війська 3 січня 2026 року. Служив у лавах 225-го окремого штурмового полку Сухопутних військ ЗСУ, мав звання солдат.
Євгеній Каньковський загинув 11 квітня 2026 року під час евакуації від поранень, отриманих внаслідок удару ворожого FPV-дрона в ході виконання бойового завдання на Запорізькому напрямку.
Євгенію було лише 30 років.
У воїна залишилась мати.
Поховали Героя на Алеї Слави кладовища у мікрорайоні Ракове.